2658-6533Научные результаты биомедицинских исследований2658-653310.18413/2658-6533-2019-5-2-0-31676ГенетикаАнализ полиморфных локусов генов ферментов антиоксидантной защиты в этнических группах республики БашкортостанAnalysis of polymorphic gene loci of antioxidant protection enzymes in three ethnic groups of the Republic of BashkortostanКочетоваОльга ВладимировнаKochetovaOlga V.Olga_mk78@mail.ruКорытинаГульназ ФаритовнаKorytinaGulnaz F.guly_kory@mail.ruАхмадишинаЛейсан ЗиннуровнаAhmadishinaLeysan Z.ВиктороваТатьяна ВикторовнаViktorovaTatiana V.vict@mail.ruМустафинаОльга ЕвгеньевнаMustafinaOlga E.20195200

Актуальность: На сегодняшний день актуальным является проведение фармакогенетического тестирования для определения индивидуальной чувствительности пациентов к лекарственным препаратам. Внедрению же в клиническую практику фармакогенетического тестирования в определенном регионе должны предшествовать популяционно-генетические исследования. Цель исследования: Цель исследования состояла в анализе популяционно-генетической структуры популяций русских, татар и башкир, проживающих в Республике Башкортостан, по аллельным вариантам генов GSTM1, GSTT1, GSTP1, CAT, GPX1, NQO1. Материалы и методы: Материалом для исследования послужили образцы ДНК русских (N=640), татар (N=462) и башкир (N=192), проживающих в Республике Башкортостан. ДНК выделяли из образцов цельной венозной крови стандартным методом фенольно-хлороформной экстракции. Генотипирование проводили с помощью ПЦР, ПЦР-ПДРФ.  Статистическую обработку результатов выполняли с помощью пакета программ MS Office Excel 2003, STATISTICA v.6.0.  и программы Haploview 4.2. Результаты: Выявлены существенные межэтнические различия по распределению частот аллелей полиморфных маркеров генов GSTM1 (Del), GSTP1 (rs1695) и NQO1 (rs1800566). Установлено сходство популяций русских, татар и башкир по распределению частот аллелей полиморфных маркеров генов GSTT1 (Del), CAT (rs1001179). Анализ данных с привлечением литературных сведений показал сходство изученных популяций с населением Европы по спектру частот аллелей и генотипов полиморфных маркеров генов GSTM1(Del), GSTT1 (Del), NQO1 (rs1131341), с населением Азии по спектру частот аллелей и генотипов гена GSTP1 (rs1695). Заключение: Распределение частот аллелей полиморфных маркеров генов GSTM1 (del), GSTP1 (rs1695l) и NQO1 (rs1800566) имеет существенные межэтнические различия.  Распределение частот аллелей полиморфных маркеров генов GSTT1, CAT, GPX1 в популяциях русских, татар и башкир сходно.

Background: The ideal dose of drugs varies widely among patients, mainly due to genetic factors. Introduction to clinical practice of pharmacogenetic testing in a certain region should be preceded by population-genetic studies. The aim of the study: To determine the prevalence of the most common allelic variants of GSTM1, GSTT1, GSTP1, CAT, GPX1, NQO1 in a representative sample of the three ethnic groups (Russians, Tatars, and Bashkirs) from the Republic of Bashkortostan (Russia), and to compare the results with existing data for other populations. Materials and methods: The genotypes were determined in 1294 DNA samples of healthy unrelated individuals, representatives of three ethnic groups (Russians (N=640), Tatars (N=462) and Bashkirs (N=192)). The gene polymorphisms were examined using PCR and PCR-RLFP methods. Results: The analysis of the GSTM1 (Del), GSTP1 (rs1695), and NQO1 (rs1800566) allele and genotype frequencies revealed significant differences among healthy residents of the Republic of Bashkortostan of different ethnicities. Distribution of allele and genotype frequencies of the GSTT1 (Del), CAT rs1001179) genes were similar in Russians, Tatars, and Bashkirs. The analysis of literature data showed similarity of ethnic groups with the population of Europe in alleles and genotypes of polymorphic markers of the GSTM1 (Del), GSTT1 (Del), NQO1 (rs1131341) genes. The distribution of alleles and genotypes of the GSTP1 (rs1695l) gene were similar of the studied ethnic groups with the population of Asia are shown. Conclusion: The frequency distribution of the alleles of polymorphic markers of the GSTM1 (del), GSTP1 (rs1695l) and NQO1 (rs1800566) genes has significant interethnic differences. The frequency distribution of the alleles of the polymorphic markers of the GSTT1, CAT, GPX1 genes in the populations of Russians, Tatars and Bashkirs is similar.

полиморфные маркерыгены ферментов антиоксидантной защитыэтнические группыфармакогенетикаgenes of antioxidant protectionpolymorphic markersethnic groupecological geneticsmetabolism

Исследование частично поддержано Российским фондом фундаментальных исследований (проекты №17-44-020735, №18-015-00050); биологический материал (ДНК) для исследования взят из коллекция биологических материалов человека ИБГ УФИЦ РАН, поддержанной программой биоресурсных коллекций ФАНО России (соглашение №007-030164/2); работа выполнена с использованием оборудования ЦКП "Биомика" и УНУ "КОДИНК" (ИБГ УФИЦ РАН).

Список литературы Клиническая фармакология: учебник / под ред. В.Г. Кукеса, Д.А. Сычева. – 5-е изд., испр. и доп. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2017.Shabaruddin F.H., Fleeman N.D., Payne K. of : and // Pharmgenomics Pers Med. 2015. N 8. P. 115-126. DOI: 10.2147 / PGPM.S35063Detection of CYP1A1 and GSTP1 gene polymorphisms in bladder cancer patients in a Turkish population using a polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism method / A. Altunkol [et al.] // Turk J Urol. 2018. Vol. 44(2). P. 125-131. DOI: 10.5152 / tud.2018.23571A study of the association of glutathione S-transferase M1/T1 polymorphisms with susceptibility to vitiligo in Egyptian patients / D.G. Aly [et al.] // Anais brasileiros de dermatologia. 2018. Vol. 93(1). Р. 54-58. DOI: http://dx.doi.org/10.1590/abd1806-4841.20185796Поиск ассоциации полиморфных маркеров генов, кодирующих ферменты антиокислительной защиты, с развитием диабетической полинейропатии у больных сахарным диабетом типа 1 / Е.В. Зотова [и др.] // Мол. Биол. 2004. Т. 38, N 2. С.244-249.Forsberg L., de Faire U., Morgenstern R. Low yield of polymorphisms from EST blast searching: analysis of genes related to oxidative stress and verification of the P197L polymorphism in GPX1 // Hum Mutat. 1999. Vol. 13(4). P. 294-300. DOI: https://doi.org/10.1002/(SICI)1098-1004(1999)13:4<294::AID-HUMU6>3.0.CO;2-5A common functional C-T substitution polymorphism in the promoter region of the human catalase gene influences transcription factor binding, reporter gene transcription and is correlated to blood catalase levels / L. Forsberg [et al.] // Free Radical Biology and Medicine. 2001. Vol. 30(5). P. 500-505. DOI: https://doi.org/10.1016/S0891-5849 (00)00487-1Ivaschenko T.E., Sideleva O.G., Baranov V.S. Glutathione- S-transferase micro and theta gene polymorphisms as new risk factors of atopic bronchial asthma // J. Mol. Med. 2002. Vol. 80(1). P. 39-43. DOI: https://doi.org/10.1007/s001090100274An association betweenNQO1 genetic polymorphism and risk of bladder cancer / S.-J. Park, [et al.] // Mutation Research. 2003. N 536. P.131-137. DOI: https://doi.org/10.1016/S1383-5718 (03) 00041-XPolymorphisms in DNA repair and metabolic genes in bladder cancer / S. Sanyal [et al.] // Carcinogenesis. 2004. N 25. P. 729-734. DOI: https://doi.org/10.1093/carcin/bgh058Haemoglobin adducts of acrylonitrile and ethylene oxide in acrylonitrile workers, dependent on polymorphisms of the glutathione transferases GSTT1 and GSTM1 / R. Thier [ // Arch Toxicol. 1999. Vol. 73(4-5). P. 197-202. DOI: https://doi.org/10.1007/s002040050606Реброва О.Ю. Статистический анализ медицинских данных. Применение пакета прикладных программ STATISTICA. М.: МедиаСфера, 2002. 305 c.Haploview: analysis and visualization of LD and haplotype maps / J.C. Barrett [et al.] // Bioinformatics. 2005. Vol. 21(2). P. 263-265. DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bth457Metabolic Gene Polymorphism Frequencies in Control Populations / S. Garte [et al.] // Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention. 2001. N 10. P. 1239-1248.Pharmacogenomic assessment of Mexican and Peruvian populations / S. Marsh [et al.] // Pharmacogenomics. 2015. Vol. 16(5). P. 441-448. DOI: https://doi.org/10.2217/pgs.15.10Joos L., Pare P., Sanford A. Genetic risk factors for chronic obstructive pulmonary disease. Swiss Med. Wkly.2002.N 132.P. 27-37.T null and M null genotypes of the glutathione S-transferase gene are risk factor for CAD independent of smoking / K.K. Abu-Amero [et al.] // BMC Medical Genetics. 2006. Vol. 7(38).  DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2350-7-38GSTT1 and gene polymorphisms in European and African populations / S. Piacentini [et al.] // Mol Biol Rep. 2011. Vol. 38(2). P. 1225-1230. DOI: https://doi.org/10.1007/s11033-010-0221-0Mansoori A.A., Jain S.K. ADH1B, ALDH2, and Gene Polymorphic Frequencies among Alcoholics and Controls in the Arcadian Population of Central India Asian // Pac J Cancer Prev. 2018. Vol. 19(3). P. 725-731. DOI: 10.22034/APJCP.2018.19.3.725Lack of associations between genetic polymorphisms in GSTM1, GSTT1 and and pancreatic cancer risk: a multi-institutional case-control study in / I. Yamada [et al.] // Asian Pac J Cancer Prev. 2014. Vol. 15(1). P. 391-395.Combinations of glutathione S-transferase genotypes and risk of early-onset lung cancer in Caucasians and African Americans: a population-based study / M.L. Cote [et al.] // Carcinogenesis. 2005. Vol. 26(4). Р. 811-819. DOI: https://doi.org/10.1093/carcin/bgi023Relationship between genotype and enzyme activity of glutathione S-transferases M1 and P1 in Chinese / S.L. Zhong [et al.] // Eur J Pharm Sci. 2006. Vol. 28(1-2). Р. 77-85. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ejps.2006.01.002A Study on Catalase Gene Promoter -21 A/T (rs7943316) in Healthy Pakistani population / S.N. Nawab [et al.] // Pak J Med Sci. 2017. Vol. 33(6). P. 1521-1524. DOI: 10.12669/pjms.336.13188Associations of NQO1 C609T and NQO1 C465T polymorphisms with acute leukemia risk: a PRISMA-compliant meta-analysis / H. He [et al.] // Onco Targets Ther. 2017. N 10. P. 1793-1801. DOI: 10.2147/OTT.S132503Genetic association of the NQO1 rs1800566 (609C>T) variant with risk of preeclampsia in the Chinese Han population / L. Zhao [et al.] // Pregnancy Hypertens. 2017. N 10. P. 42-45. DOI: https://doi.org/10.1016/j.preghy.2017.05.004Association of NAD(P)H:quinine oxidoreductase 1 (NQO1) C609T polymorphism with esophageal squamous cell carcinoma in a German Caucasian and a northern Chinese population / J. Zhang [et al.] // Carcinogenesis. 2003. Vol. 24(5). P. 905-909. DOI: https://doi.org/10.1093/carcin/bgg019