Список литературы

2658-6533

Научные результаты биомедицинских исследований

2658-6533

10.18413/2658-6533-2019-5-4-0-1

1833

Генетика

Роль взаимодействия полиморфных локусов гена <em>FLG</em> в формировании хронической истинной экземы у женщин

The role of interaction of polymorphic loci of the <em>FLG</em> gene in the development of chronic true eczema in women

Беляева

Татьяна Михайловна

Belyaeva

Tatyana M.

tb201446@yandex.ru

2019

5400

Актуальность: Экзема является мультифакториальным заболеванием, развитие которого определяется полигенной основой и действием провоцирующих факторов экзогенной и эндогенной природы. Цель исследования: Проанализировать роль взаимодействия полиморфных локусов гена филаггрина (FLG) в формировании хронической истинной экземы у женщин. Материалы и методы: Для исследования была сформирована выборка, включающая 446 женщин, в том числе 233 пациентки с хронической истинной экземой и 213 женщин без данного заболевания. Все женщины, включенные в исследование, прошли необходимое клиническое и клинико-лабораторное обследование. Выполнено генотипирование девяти полиморфных локусов гена филаггрина. SNP×SNP взаимодействия, вовлеченные в формирование хронической истинной экземы, изучались с помощью программного обеспечения АРSampler (использовался метод Монте-Карло марковских цепей и байесовская непараметрическая статистика) и MDR (основан на методе снижения размерности MDR). Результаты: В состав двух- и трех-локусных моделей, ассоциированных с формированием заболевания, входят пять полиморфных локусов – rs61816761, rs4363385, rs77199844, rs471144 и rs558269137 гена FLG. Полиморфизмы rs4363385 и rs77199844 включены в наибольшее количество моделей (по 6 моделей соответственно). SNP×SNP взаимодействия rs471144× rs77199844 и  rs471144× rs4363385 определяют -0,84% и -0,77% энтропии признака соответственно. Полиморфные локусы rs77199844 и  rs471144  локализованы в регионе регуляторных мотивов ДНК к 12 транскрипционным факторам, а полиморфизм rs4363385 гена FLG ассоциирован с уровнем экспрессии девяти генов в коже (SPRR1B, LCE3C, LCE1D, SPRR2D, SPRR2B, LCE3A, LCE1E, SPRR1A, SPRR3). Заключение: Взаимодействия полиморфных локусов гена FLG ассоциированы с формированием хронической истинной экземы у женщин.

Background: Eczema is a multifactorial disease. Its development is determined by the polygenic basis and the action of inciting events of exogenous and endogenous nature. The aim of the study: To analyze the role of interaction of polymorphic loci of the filaggrin gene (FLG) in the development of chronic true eczema in women. Materials and methods: A sample of 446 women was formed for the study, including 233 patients with chronic true eczema and 213 women without the disease. All women involved in the study underwent the necessary clinical and clinical laboratory examination. Nine polymorphic loci of the filaggrin gene were genotyped. The SNP×SNP interactions involved in the formation of chronic true eczema were studied using the АРSampler software (using the Monte Carlo Markov chain method and Bayesian nonparametric statistics) and MDR (based on the MDR dimension reduction method). Results: The two-and three-locus models associated with disease formation include five polymorphic loci-rs61816761, rs4363385, rs77199844, rs471144, and rs558269137 of the FLG gene. Polymorphisms rs4363385 and rs77199844 are included in the largest number of models (6 models respectively). SNP×SNP interactions rs471144× rs77199844 and rs471144× rs4363385 determine -0.84% and -0.77% of trait entropy respectively. Polymorphic loci rs77199844 and rs471144 are localized in the region of DNA regulatory motives to 12 transcription factors, and polymorphism rs4363385 of the FLG gene is associated with the expression level of nine genes in the skin (SPRR1B, LCE3C, LCE1D, SPRR2D, SPRR2B, LCE3A, LCE1E, SPRR1A, SPRR3). Conclusion: Interactions of polymorphic loci of the FLG gene are associated with the development of chronic true eczema in women.

полиморфизмассоциацииSNP×SNP взаимодействияхроническая истинная экземаженщиныFLG

polymorphismassociationsSNP×SNP interactionschronic true eczemawomenFLG

Список литературы

Федеральные клинические рекомендации. Дерматовенерология 2015: Болезни кожи. Инфекции, передаваемые половым путем. 5-е изд., перераб. и доп. М.: Деловой экспресс, 2016. 768 с.

Weidinger S., Novak N. Atopic dermatitis // Lancet. 2016. Vol. 387(10023). P. 1109-1122. DOI: 10.1016/S0140-6736(15)00149-X

Genome-wide comparative analysis of atopic dermatitis and psoriasis gives insight into opposing genetic mechanisms / H. Baurecht [et al.] // . 2015. Vol. 96(1). P. 104-120. DOI: 10.1016/j.ajhg.2014.12.004

Современные особенности клиники, диагностики и терапии больных экземой / Л.А. Юсупова [и др.] // Лечащий врач. 2018. N 6. С. 85.

The etiopathogenesis of atopic dermatitis: barrier disruption, immunological derangement, and pruritus / P. Rerknimitr [et al.] // Inflamm Regen. 2017. N 37. P. 14-15. DOI: 10.1186/s41232-017-0044-7

Bin L, Leung DY. Genetic and epigenetic studies of atopic dermatitis // Allergy Asthma Clin Immunol. 2016. N 12. P. 52. DOI: 10.1186/s13223-016-0158-5

Meta-analysis identifies seven susceptibility loci involved in the atopic march / I. Marenholz [et al.] // Nat Commun. 2015. N 6. P. 8804. DOI: 10.1038/ncomms9804

Meta-analysis of genome-wide association studies identifies three new risk loci for atopic dermatitis / L. Paternoster [et al.] // Nat. Genet. 2012. N 44. P. 187-192. DOI: 10.1038/ng.1017

Genome-wide association study identifies two new susceptibility loci for atopic dermatitis in the Chinese Han population / L.D. Sun [et al.] // Nat. Genet. 2011. N 43. P. 690-694. DOI: 10.1038/ng.851

A common variant on chromosome 11q13 is associated with atopic dermatitis / J. Esparza-Gordillo [et al.] // Nat. Genet. 2009. N 41. P. 596-601. DOI: 10.1038/ng.347

Genome-wide association study identifies eight new susceptibility loci for atopic dermatitis in the Japanese population / T. Hirota [et al.] // Nat. Genet. 2012. N 44. P. 1222-1226. DOI: 10.1038/ng.2438

Filaggrin Gene Mutation c.332 delA is associated with various clinical features of atopic dermatitis in the Chinese han population / L. Meng [et al.] // PLoS One. 2014. N 9. P. e98235. DOI: 10.1371/journal.pone.0098235

Filaggrin Mutation in Korean Patients with Atopic Dermatitis / H.R. On [et al.] // Yonsei Med J. 2017. Vol. 58(2). P. 395-400. DOI: 10.3349/ymj.2017.58.2.395

Репликация данных полногеномных анализов ассоциации атопического дерматита в Республике Башкортостан / Г.Ф. Гималова [и др.] // Медицинская генетика. 2016. Т. 15, N 4. С. 25-28. DOI: https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-4-25-28

The study of filaggrin gene mutations and copy number variation in atopic dermatitis patients from volga-ural region of Russia / G.F. Gimalova [et al.] // GENE. 2016. Vol. 591(1). P. 85-89. DOI: https://doi.org/10.1016/j.gene.2016.06.054

Популяционно-генетические характеристики и генетико-эпидемиологическое исследование ассоциаций генов-кандидатов с мультифакториальными заболеваниями / И.Н. Сорокина [и др.] // Научные результаты биомедицинских исследований. 2018. Т. 4, N 4. С. 20-30. DOI: 10.18413/2313-8955-2018-4-4-0-3

A Markov chain Monte Carlo technique for identification of combinations of allelic variants underlying complex diseases in humans / A.V. Favorov [et al.] // Genetics. 2005. Vol. 171(4). P. 2113-2121. DOI: 10.1534/genetics.105.048090

Lvovs D., Favorova O.O., Favorov A.V. A Polygenic Approach to the Study of Polygenic Diseases // Acta Naturae. 2012. Vol. 4(3). P. 59-71.

Полиморфный локус rs314276 гена LIN28B ассоциирован с возрастом менархе у женщин Центрального Черноземья России / И.В. Пономаренко [и др.] // Акушерство и гинекология. 2019. N 2. С. 98-104. DOI: 10.18565/aig.2019.2.98-104

Пономаренко И.В., Полоников А.В., Чурносов М.И.Полиморфные локусы гена LHCGR, ассоциированные с развитием миомы матки // Акушерство и гинекология. 2018. N 10. С. 86-91. DOI: https://dx.doi.org/10.18565/aig.2018.10.86-91

Мальченко Е.Е., Немчанинова О.Б., Максимов В.Н. Роль филаггрина в развитии хронических заболеваний кожи. Обзор литературы // Journal of Siberian Medical Sciences. 2015. N 3. С. 28.

Мутации гена филаггрина как фактор нарушения регуляции эпидермального барьера у детей / С.В. Левашева [и др.] // Лечащий Врач. 2016. N 1. С. 24.

Čepelak I., Dodig S., Pavić I. Filaggrin and atopic march // . 2019. Vol. 29(2). P. 020501. DOI: 10.11613/BM.2019.020501

Brown S.J., McLean W.H. One remarkable molecule: filaggrin // . 2012. Vol. 132(3 Pt 2). P. 751-762. DOI: 10.1038/jid.2011.393

Čepelak I., Dodig S., Filipović-Grčić J. Filaggrin – multifunctional protein // Acta Med Croatica. 2016. N 70. P. 125-30.

Shared genetic origin of asthma, hay fever and eczema elucidates allergic disease biology / M.A. Ferreira [et al.] // . 2017. Vol. 49(12). P. 1752-1757. DOI: 10.1038/ng.3985

Genetic Architectures of Childhood- and Adult-Onset Asthma Are Partly Distinct / M.A.R. Ferreira [et al.] // . 2019. Vol. 104(4). P. 665-684. DOI: 10.1016/j.ajhg.2019.02.022