Актуальность: Ферменты фолатного цикла регулируют ключевые реакции в фолат-опосредованном одноуглеродном метаболизме. Нарушения фолатного цикла могут быть связаны с возникновением плацентарной недостаточности с синдромом задержки роста плода (СЗРП) у беременных, однако на сегодняшний день связь полиморфизма генов фолатного цикла с развитием патологии течения беременности изучена недостаточно. Цель исследования: Изучение ассоциации полиморфных локусов генов фолатного цикла с развитием СЗРП 2-3 степени. Материалы и методы: Выборку для исследования составили 112 беременных с СЗРП 2-3 степени и 243 беременных с нормальным весом новорожденного. Изучались полиморфные локусы генов фолатного цикла rs1805087 гена MTR, rs1801394 гена MTRR, rs1979277 гена SHMT1, rs699517 гена TYMS, rs2790 гена TYMS. Исследование проводили методом ПЦР с использованием соответствующих олигонуклеотидных праймеров и зондов с последующим анализом полиморфизмов методом детекции TaqMan зондов (real-time ПЦР). Анализ ассоциаций проводился с использованием программного обеспечения gPLINK v2.050. Межгенные взаимодействия в двух- и трехлокусных моделях анализировали с помощью метода MDR и его модификации GMDR. Результаты: Показано, что аллель Т rs1979277 гена SHMT1 ассоциирован с развитием СЗРП 2-3 степени в рамках аддитивной (OR=1,56, 95%Сl 1,10-2,22, р=0,012, рperm=0,011) и рецессивной (OR=2,55, 95%Сl 1,24-5,22, р=0,011, рperm=0,007) моделей. Выявлена ассоциация аллеля G rs1805087 гена MTR с формированием СЗРП 2-3 степени в соответствии с рецессивной моделью (OR=3,28, 95%Сl 1,14-9,47, р=0,028, рperm=0,014). Выявлены две 2-х локусных и одна трехлокусная модели SNP х SNP взаимодействий, ассоциированных с развитием СЗРП 2-3 степени. В состав значимых моделей входят три полиморфных локуса - rs1979277 SHMT1, rs1805087 MTR и rs1801394 MTRR. Парное взаимодействие rs1801394 MTRR х rs1979277 SHMT1 является основой двух наиболее значимых моделей ген-генных взаимодействий, ассоциированных с развитием СЗРП 2-3 степени. Заключение: Полиморфные локусы rs1979277 SHMT1, rs1805087 MTR и rs1801394 MTRR ассоциированы с развитием СЗРП 2-3 степени.
Background: Folate cycle enzymes regulate key reactions in folate-mediated single-carbon metabolism. The folate cycle disturbances may be associated with the occurrence of placental insufficiency with fetal growth restriction syndrome (FGRS) in pregnant women, however, to date, the relationship of polymorphism of the folate cycle genes with the development of pregnancy pathology has not been examined in sufficient detail. The aim of the study: To study the association of polymorphic loci of the folate cycle genes with the development of 2-3-degree FGRS. Materials and methods: The sample for the study included 112 pregnant women with 2-3-degree FGRS and 243 pregnant women with normal birth weight. The polymorphic loci of the folate cycle gene rs1805087 of the MTR gene were studied, rs1801394 of the MTRR gene, rs1979277 of the SHMT1 gene, rs699517 of the TYMS gene, rs2790 of the TYMS gene involved in the formation of placental insufficiency and FGRS of the 2nd or 3rd degrees. The study was carried out by PCR using the appropriate oligonucleotide primers and probes, followed by analysis of polymorphisms by the detection method of TaqMan probes (real-time PCR). Association analysis was performed using gPLINK v2.050 software. Intergenic interactions in two- and three-locus models were analyzed using MDR method and its GMDR modifications. Results: It was shown that the T allele rs1979277 of the SHMT1 gene is associated with the development of 2-3-degree FGRS in the framework of additive (OR = 1.56, 95% Cl 1,10 - 2,22, p = 0,012, pperm = 0.011) and recessive (OR = 2.55, 95% Cl 1.24-5.22, p = 0,011, pperm = 0.007) models. The association of the G rs1805087 allele of the MTR gene with the formation of 2-3-degree FGRS was revealed in accordance with the recessive model (OR = 3.28, 95% Cl 1.14-9.47, p = 0.028, pperm = 0.014). Two 2-locus and one three-locus models of SNPxSNP interactions associated with the development of FGRS 2-3 degrees were identified. Significant models include three polymorphic loci – rs1979277 SHMT1, rs1805087 MTR, and rs1801394 MTRR. Pairwise interaction rs1801394 MTRR x rs1979277 SHMT1 is the basis of the two most significant models of gene-gene interactions associated with the development of FGRS of 2-3 degrees. Conclusion: Polymorphic loci rs1979277 SHMT1, rs1805087 MTR and rs1801394 MTRR are associated with the development of FGRS of 2-3 degrees.