<?xml version='1.0' encoding='utf-8'?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.2 20190208//EN" "http://jats.nlm.nih.gov/publishing/1.2/JATS-journalpublishing1.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="ru" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="issn">2658-6533</journal-id><journal-title-group><journal-title>Научные результаты биомедицинских исследований</journal-title></journal-title-group><issn pub-type="epub">2658-6533</issn></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.18413/2658-6533-2020-6-2-0-2</article-id><article-id pub-id-type="publisher-id">2037</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Генетика</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>&lt;strong&gt;Изучение ассоциаций гаплотипов полиморфизма гена&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;em&gt;FLG&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;с развитием хронической истинной экземы у мужчин&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;
&amp;nbsp;</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>&lt;strong&gt;Study of associations of haplotypes of &lt;em&gt;FLG &lt;/em&gt;gene polymorphism with the development of chronic true eczema in men&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;
&amp;nbsp;</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="ru"><surname>Беляева</surname><given-names>Татьяна Михайловна</given-names></name><name xml:lang="en"><surname>Belyaeva</surname><given-names>Tatyana M.</given-names></name></name-alternatives><email>tb201446@yandex.ru</email></contrib></contrib-group><pub-date pub-type="epub"><year>2020</year></pub-date><volume>6</volume><issue>2</issue><fpage>0</fpage><lpage>0</lpage><self-uri content-type="pdf" xlink:href="/media/medicine/2020/2/document._июнь_2020pdf-12-23.pdf" /><abstract xml:lang="ru"><p>Актуальность: Экзема является распространенным хроническим заболеванием, характеризующимся воспалением кожи. Цель исследования: Провести анализ вовлеченности гаплотипов полиморфных локусов гена филаггрина (FLG) в развитие хронической истинной экземы у мужчин. Материалы и методы: Выборка для исследования включала 203 мужчины, в том числе 113 больных с хронической истинной экземой и 90 мужчин без данной патологии. Проведено генотипирование 10 полиморфных локусов гена FLG. С помощью программы Haploview v.4.2 выполнен анализ неравновесия по сцеплению между SNPs и построены гаплоблоки. В соответствии с алгоритмами &amp;laquo;Solid Spine&amp;raquo; и &amp;laquo;Four gamete frequencies&amp;raquo; с заданным порогом D&amp;rsquo;&amp;gt;0,8 определялась блочная структура. Расчет частот гаплотипов и анализ их ассоциаций с формированием заболевания осуществляли с помощью программного обеспечения PLINK v. 2.050 по ЕМ-алгоритму. Результаты: Установлено 6 гаплоблоков как в целом в объединённой выборке мужчин, больных хронической истинной экземой и контроля, так и отдельно в группах больных и мужчин контроля. Значимых ассоциаций гаплотипов в рамках шести рассматриваемых гаплоблоков с возникновением хронической истинной экземоы у мужчин не выявлено. Анализ вовлеченности гаплотипов полиморфных локусов гена FLG, находящихся в неравновесии по сцеплению, показал значимую ассоциацию гаплотипа GG rs61816761-rs3126085 с хронической истинной экземой у мужчин (ОR=0,47, р=0,035, ррerm=0,045). Заключение: Гаплотип GG полиморфных локусов rs61816761-rs3126085 гена FLG вовлечен в развитие хронической истинной экземы у мужчин.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Background: Eczema is a common chronic disease characterized by inflammation of the skin. The aim of the study: To analyze the involvement of haplotypes of polymorphic loci of the filaggrin gene (FLG) in the development of chronic true eczema in men. Materials and methods: The sample for the study included 203 men, including 113 patients with chronic true eczema and 90 men without this pathology. Genotyping of 10 polymorphic loci of the FLG gene was performed. The haploview V. 4.2 program was used to analyze the coupling disequilibrium between SNPs and to construct haploblocks. In accordance with the algorithms &amp;quot;Solid Spine&amp;quot; and &amp;quot;Four gamete frequencies&amp;quot; with a specified threshold D&amp;#39;&amp;gt;0.8, the block structure was determined. The calculation of haplotype frequencies and analysis of their associations with the formation of the disease was performed using the PLINK V. 2.050 software using the EM algorithm. Results: 6 haploblocks were found both in the combined sample of men with chronic true eczema and control, and separately in the groups of patients and control men. There were no significant associations of haplotypes in the six haploblocks considered with the occurrence of chronic true eczema in men. Analysis of the involvement of haplotypes of polymorphic loci of the FLG gene, which are in non-equilibrium by coupling, showed a significant association of the GG rs61816761-rs3126085 haplotype with chronic true eczema in men (OR=0.47, p=0.035, ррerm=0.045). Conclusion: The GG haplotype of the rs61816761-rs3126085 polymorphic loci of the FLG gene is involved in the development of chronic true eczema in men.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>полиморфизм</kwd><kwd>ассоциации</kwd><kwd>ген филаггрина</kwd><kwd>хроническая истинная экзема</kwd><kwd>мужчины</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>polymorphism</kwd><kwd>associations</kwd><kwd>the filaggrin gene</kwd><kwd>chronic true eczema</kwd><kwd>men</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>Список литературы</title><ref id="B1"><mixed-citation>Федеральные клинические рекомендации. Дерматовенерология 2015: Болезни кожи. Инфекции, передаваемые половым путем. 5-е изд., перераб. и доп. М.: Деловой экспресс; 2016.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><mixed-citation>Zhu J, Wang Z, Chen F. Association of Key Genes and Pathways with Atopic Dermatitis by Bioinformatics Analysis.&amp;nbsp;Medical Science Monitor. 2019;25:4353-4361. DOI: 10.12659/MSM.916525</mixed-citation></ref><ref id="B3"><mixed-citation>Minzaghi D, Pavel P, Dubrac S. Xenobiotic Receptors and Their Mates in Atopic Dermatitis. International Journal of Molecular Sciences. 2019;20(17):4234. DOI: https://doi.org/10.3390/ijms20174234</mixed-citation></ref><ref id="B4"><mixed-citation>Kim JE, Kim JS, Cho DH, et al. Molecular Mechanisms of Cutaneous Inflammatory Disorder: Atopic Dermatitis. International Journal of Molecular Sciences. 2016;17(8):1234. DOI: https://doi.org/10.3390/ijms17081234</mixed-citation></ref><ref id="B5"><mixed-citation>Wallmeyer L, Dietert K, Sochorov&amp;aacute; M, et al. TSLP is a direct trigger for T cell migration in filaggrin-deficient skin equivalents. Scientific Reports. 2017;7(1):774. DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-017-00670-2</mixed-citation></ref><ref id="B6"><mixed-citation>Tanjung C, Rzehak P, Mansyur M, et al. Study protocol to investigate the environmental and genetic aetiology of atopic dermatitis: the Indonesian Prospective Study of Atopic Dermatitis in Infants (ISADI). BMJ Open. 2017;7(3):e012475. DOI: http://dx.doi.org/10.1136/bmjopen-2016-012475</mixed-citation></ref><ref id="B7"><mixed-citation>Margolis DJ, Mitra N, Gochnauer H, et al. Uncommon Filaggrin Variants Are Associated with Persistent Atopic Dermatitis in African Americans [published correction appears in J Invest Dermatol. 2018 Sep;138(9):2084-2085].&amp;nbsp;Journal of Investigative Dermatology. 2018;138(7):1501-1506. DOI: 10.1016/j.jid.2018.01.029</mixed-citation></ref><ref id="B8"><mixed-citation>Rerknimitr P, Otsuka A, Nakashima C, et al. The etiopathogenesis of atopic dermatitis: barrier disruption, immunological derangement, and pruritus. Inflamm Regen. 2017;37:14-15. DOI: 10.1186/s41232-017-0044-7</mixed-citation></ref><ref id="B9"><mixed-citation>Bin L, Leung DYM. Genetic and epigenetic studies of atopic dermatitis. Allergy, Asthma and Clinical Immunology. 2016;12:52. DOI: https://doi.org/10.1186/s13223-016-0158-5</mixed-citation></ref><ref id="B10"><mixed-citation>Marenholz I, Esparza-Gordillo J, R&amp;uuml;schendorf F, et al. Meta-analysis identifies seven susceptibility loci involved in the atopic march. Nature Communications. 2015;6:8804. DOI: 10.1038/ncomms9804</mixed-citation></ref><ref id="B11"><mixed-citation>Гималова ГФ, Карунас АС, Федорова ЮЮ, и др. Репликация данных полногеномных анализов ассоциации атопического дерматита в Республике Башкортостан. Медицинская генетика. 2016;15(4):25-28. DOI: https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-4-25-28</mixed-citation></ref><ref id="B12"><mixed-citation>Gimalova GF, Karunas AS, Fedorova YY, et al. The study of filaggrin gene mutations and copy number variation in atopic dermatitis patients from volga-ural region of Russia. Gene. 2016;591(1):85-89. DOI: https://doi.org/10.1016/j.gene.2016.06.054</mixed-citation></ref><ref id="B13"><mixed-citation>Пономаренко ИВ, Решетников ЕА, Полоников АВ, и др. Полиморфный локус rs314276 гена LIN28B ассоциирован с возрастом менархе у женщин Центрального Черноземья России. Акушерство и гинекология. 2019;2:98-104. DOI: https://dx.doi.org/10.18565/aig.2019.2.98-104</mixed-citation></ref><ref id="B14"><mixed-citation>Пономаренко ИВ, Полоников АВ, Чурносов МИ. Полиморфные локусы гена LHCGR, ассоциированные с развитием миомы матки. Акушерство и гинекология. 2018;10:86-91. DOI: https://dx.doi.org/10.18565/aig.2018.10.86-91</mixed-citation></ref><ref id="B15"><mixed-citation>Ponomarenko I, Reshetnikov E, Altuchova O, et al. Association of genetic polymorphisms with age at menarche in Russian women. Gene. 2019;686:228-236. DOI: https://doi.org/10.1016/j.gene.2018.11.042</mixed-citation></ref><ref id="B16"><mixed-citation>Eaaswarkhanth M, Xu D, Flanagan C, et al. Atopic Dermatitis Susceptibility Variants in Filaggrin Hitchhike Hornerin Selective Sweep. Genome Biology and Evolution. 2016;8(10):3240-3255. DOI: https://doi.org/10.1093/gbe/evw242</mixed-citation></ref><ref id="B17"><mixed-citation>Jarrett R, Salio M, Lloyd-Lavery A, et al. Filaggrin inhibits generation of CD1a neolipid antigens by house dust mite-derived phospholipase. Science Translational Medicine. 2016;8(325):325ra18. DOI: 10.1126/scitranslmed.aad6833</mixed-citation></ref><ref id="B18"><mixed-citation>Clausen ML, Agner T, Lilje B, et al. Association of Disease Severity With Skin Microbiome and Filaggrin Gene Mutations in Adult Atopic Dermatitis. JAMA Dermatology. 2018;154(3):293-300. DOI: 10.1001/jamadermatol.2017.5440</mixed-citation></ref><ref id="B19"><mixed-citation>Ziyab AH, Ewart S, Lockett GA, et al. Expression of the filaggrin gene in umbilical cord blood predicts eczema risk in infancy: A birth cohort study. Clinical and Experimental Allergy. 2017;47(9):1185-1192. DOI: https://doi.org/10.1111/cea.12956</mixed-citation></ref><ref id="B20"><mixed-citation>Čepelak I, Dodig S, Pavić I. Filaggrin and atopic march.&amp;nbsp;. 2019;29(2):020501. DOI: 10.11613/BM.2019.020501</mixed-citation></ref><ref id="B21"><mixed-citation>Kichaev G, Bhatia G, Loh PR, et al. Leveraging Polygenic Functional Enrichment to Improve GWAS Power. American Journal of Human Genetics. 2019;104(1):65-75. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2018.11.008</mixed-citation></ref><ref id="B22"><mixed-citation>Zhu Z, Zhu X, Liu CL, et al. Shared genetics of asthma and mental health disorders: a large-scale genome-wide cross-trait analysis. &amp;nbsp;European Respiratory Journal. 2019;54(6):1901507. DOI: 10.1183/13993003.01507-2019</mixed-citation></ref><ref id="B23"><mixed-citation>Ferreira MA, Vonk JM, Baurecht H, et al. Shared genetic origin of asthma, hay fever and eczema elucidates allergic disease biology. Nature Genetics. 2017;49(12):1752-1757. DOI: http://dx.doi.org/10.1038/ng.3985</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>