<?xml version='1.0' encoding='utf-8'?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.2 20190208//EN" "http://jats.nlm.nih.gov/publishing/1.2/JATS-journalpublishing1.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="ru" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="issn">2658-6533</journal-id><journal-title-group><journal-title>Научные результаты биомедицинских исследований</journal-title></journal-title-group><issn pub-type="epub">2658-6533</issn></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.18413/2658-6533-2024-10-3-0-1</article-id><article-id pub-id-type="publisher-id">3502</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Генетика</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>&lt;strong&gt;Варианты генов &lt;em&gt;Mycobacterium tuberculosis&lt;/em&gt;, ассоциированные с лекарственной устойчивостью к фторхинолонам (обзор литературы)&lt;/strong&gt;</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Mycobacterium tuberculosis&lt;/em&gt; gene variants associated with drug resistance to fluoroquinolones (literature review)&lt;/strong&gt;</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="ru"><surname>Гордеева</surname><given-names>Елизавета Игоревна</given-names></name><name xml:lang="en"><surname>Gordeeva</surname><given-names>Elizaveta I.</given-names></name></name-alternatives><email>mbtnniit20@gmail.com</email></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="ru"><surname>Филиппов</surname><given-names>Павел Николаевич</given-names></name><name xml:lang="en"><surname>Filippov</surname><given-names>Pavel N.</given-names></name></name-alternatives><email>filippovPN@dcli.ru</email></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="ru"><surname>Турсунова</surname><given-names>Наталья Владимировна</given-names></name><name xml:lang="en"><surname>Tursunova</surname><given-names>Natalia V.</given-names></name></name-alternatives><email>natalya-tursunova@mail.ru</email></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="ru"><surname>Салмин</surname><given-names>Алексей Валерьевич</given-names></name><name xml:lang="en"><surname>Salmin</surname><given-names>Alexey V.</given-names></name></name-alternatives><email>salmin.a@list.ru</email></contrib></contrib-group><pub-date pub-type="epub"><year>2024</year></pub-date><volume>10</volume><issue>3</issue><fpage>0</fpage><lpage>0</lpage><self-uri content-type="pdf" xlink:href="/media/medicine/2024/3/Биомедисследования-6-20.pdf" /><abstract xml:lang="ru"><p>Актуальность: Распространение лекарственной устойчивости M. tuberculosis к фторхинолонам представляет угрозу для их долгосрочной клинической эффективности. Понимание механизмов формирования лекарственной устойчивости к фторхинолонам, основанное на информации о генах, ассоциированных с лекарственной устойчивостью M. tuberculosis, важно для оптимизации режимов химиотерапии туберкулеза. Цель исследования: Изучить имеющиеся в мировой литературе данные о наиболее значимых вариантах генов M. tuberculosis, ассоциированных с лекарственной устойчивостью к фторхинолонам. Материалы и методы: Для достижения поставленной цели проводился анализ источников отечественной и иностранной литературы по данной проблеме преимущественно за последние 5 лет. Использовались базы данных научных электронных библиотек PubMed, Elibriary. Результаты: Устойчивость микобактерий к фторхинолонам связана с мутациями генов gyrA и gyrВ, кодирующих субъединицы GyrA и GyrВ ДНК-гиразы, основной мишени действия фторхинолонов. В фторхинолон-связывающем кармане каталитического центра &amp;laquo;ДНК-гираза+ДНК&amp;raquo; молекула фторхинолона поддерживается участками&amp;nbsp;gyrA и gyrВ, определяющим устойчивость к фторхинолонам (QRDR-A и QRDR-B). Модификация любого из составляющих фрагментов этих участков влияет на уровень устойчивости к ФХ. Молекулы хинолонов небольшого размера (налидиксовая кислота), имеют высокую МИК в отношении Mtb и других бактерий, а молекулы ФХ больших размеров (спарфлоксацин, ситафлоксацин, гатифлоксацин, левофлоксацин и моксифлоксацин) плотно прилегают к фторхинолон-связывающему карману, и их МИК ниже.&amp;nbsp;Модификация структуры ДНК может изменять пространственную структуру самого кармана, что приводит к дестабилизации фторхинолона внутри него.&amp;nbsp;Таким образом, наличие гетерорезистентности возбудителя туберкулеза к фторхинолонам свидетельствует об активном формировании его устойчивости к этой группе препаратов в современных условиях. Заключение: Анализ современных исследований показывает зависимость лекарственной устойчивости микобактерий от концентрации фторхинолонов, при этом чаще всего резистентность к низким концентрациям фторхинолонов ассоциирована с заменами в гене gyrB, а к высоким &amp;ndash; с мутациями в гене gyrA. Также установлено и описано, что помимо основных изученных регионов генов gyrA и gyrB, ассоциированных с фенотипической лекарственной устойчивостью к фторхинолонам, есть участки, недостаточно изученные на данный момент. Эти участки невозможно диагностировать в условиях клинической работы бактериологических лабораторий противотуберкулёзных учреждений</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Background: The spread of M. tuberculosis drug resistance to fluoroquinolones poses a threat to their long-term clinical efficacy. Understanding the mechanisms of formation of drug resistance to fluoroquinolones, based on information on genes associated with drug resistance of M. tuberculosis, is important for optimizing TB chemotherapy regimens. The aim of the study: To study the available literature data on the most significant variants of M. tuberculosis genes associated with drug resistance to fluoroquinolones. Materials and methods: To achieve this goal, the task was to analyze the sources of domestic and foreign literature on this priority issue over the past 5 years. The databases of scientific electronic libraries PubMed, Elibriary were used. Results: Mycobacterial resistance to fluoroquinolones is associated with mutations in the gyrA and gyrB genes, encoding the GyrA and GyrB subunits of DNA gyrase, the main target of fluoroquinolones. In the fluoroquinolone-binding pocket of the &amp;ldquo;DNA-gyrase + DNA&amp;rdquo; catalytic center, the fluoroquinolone molecule is supported by the gyrA and gyrB regions, which determine resistance to fluoroquinolones (QRDR-A and QRDR-B). Modification of any of the constituent fragments of these regions affects the level of resistance to fluoroquinolones. Small quinolone molecules (nalidixic acid) have a high MIC against Mtb and other bacteria, while larger PC molecules (sparfloxacin, sitafloxacin, gatifloxacin, levofloxacin and moxifloxacin) are tightly adjacent to the fluoroquinolone-binding pocket and have a lower MIC. Modification of the DNA structure can change the spatial structure of the pocket itself, which leads to destabilization of the fluoroquinolone inside it. Thus, the presence of heteroresistance of the tuberculosis pathogen to fluoroquinolones indicates the active development of its resistance to this group of drugs in modern conditions. Conclusion: Analysis of modern studies shows the dependence of drug resistance of mycobacteria on fluoroquinolone compounds, while most often resistance to a decrease in the concentration of fluoroquinolones is associated with substitutions in the gyrB gene, as well as mutations in the gyrA gene. It has also been established that in addition to the main studied regions of the gyrA and gyrB genes associated with phenotypic drug resistance to fluoroquinols, there are regions that have not been sufficiently studied so far. These areas cannot be diagnosed in the clinical work of bacteriological laboratories of anti-tuberculosis institutions</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>туберкулез</kwd><kwd>фторхинолоны</kwd><kwd>лекарственная устойчивость</kwd><kwd>Mycobacterium tuberculosis</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>tuberculosis</kwd><kwd>fluoroquinolones</kwd><kwd>drug resistance</kwd><kwd>Mycobacterium tuberculosis</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>Список литературы</title><ref id="B1"><mixed-citation>Антропова ГА, Оконенко ТИ. Фармацевтическое информирование: фокус на фторхинолоны. Вестник Новгородского государственного университета. 2021;124(3):65-72. DOI: https://doi.org/10.34680/2076-8052.2021.3(124).65-72</mixed-citation></ref><ref id="B2"><mixed-citation>Panova AE, Vinokurov AS, Shemetova AA, et al. Molecular characteristics of Mycobacterium tuberculosis drug-resistant isolates from HIV- and HIV+ tuberculosis patients in Russia. BMC Microbiology. 2022;22(1):138. DOI: https://doi.org/10.1186/s12866-022-02553-7</mixed-citation></ref><ref id="B3"><mixed-citation>Васильева ИА, Тестов ВВ, Стерликов СА. Эпидемическая ситуация по туберкулезу в годы пандемии COVID-19 &amp;ndash; 2020-2021 гг. Туберкулез и болезни легких. 2022;100(3):6-12. DOI: https://doi.org/10.21292/2075-1230-2022-100-3-6-12</mixed-citation></ref><ref id="B4"><mixed-citation>Землянко ОМ, Рогоза ТМ, Журавлева ГА. Механизмы множественной устойчивости бактерий к антибиотикам. Экологическая генетика. 2018;16(3):4-17. DOI: https://doi.org/10.17816/ecogenl634-17</mixed-citation></ref><ref id="B5"><mixed-citation>Исаева ЮД, Крылова ЛЮ, Макарова МВ, и др. Определение основных характеристик лекарственной чувствительности M. tuberculosis к фторхинолонам и аминогликозидам/капреомицину. Туберкулез и социально-значимые заболевания. 2015;4:20-28.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><mixed-citation>Аналитические обзоры по туберкулезу [Электронный ресурс] [дата обращения 10.06.2023] URL: https://old.mednet.ru/images/stories/files/CMT/tb_resursy_2016-2017.pdf</mixed-citation></ref><ref id="B7"><mixed-citation>Матчанова ФС. Актуальность проблемы резистентности к противомикробным препаратам в мире. Вестник КазНМУ. 2018;2:365-368.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><mixed-citation>Ефименко ТА, Терехова ЛП, Ефременкова ОВ. Современное состояние проблемы антибиотикорезистентности патогенных бактерий. Антибиотики и Химиотерапия. 2019;64(5-6):64-68. DOI: https://doi.org/10.24411/0235-2990-2019-100033</mixed-citation></ref><ref id="B9"><mixed-citation>World Health Organization et al. Catalogue of mutations in Mycobacterium tuberculosis complex and their association with drug resistance [Электронный ресурс]; 2021 [дата обращения 10.06.2023]. URL: https://www.who.int/publications/i/item/9789240028173</mixed-citation></ref><ref id="B10"><mixed-citation>Singh PK, Singh U, Jain A. Emergence of Specific gyrA Mutations Associated High-Level Fluoroquinolone-Resistant Mycobacterium tuberculosis among Multidrug-Resistant Tuberculosis Cases in North India. Microbial Drug Resistance. 2021;27(5):647-651. DOI: &amp;nbsp;https://doi.org/10.1089/mdr.2020.0240</mixed-citation></ref><ref id="B11"><mixed-citation>Sirgel FA, Warren RM, Streicher EM, et al. GyrA mutations and phenotypic susceptibility levels to ofloxacin and moxifloxacin in clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis. Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 2012;67(5):1088-1093. DOI: https://doi.org/10.1093/jac/dks033</mixed-citation></ref><ref id="B12"><mixed-citation>Hasan Z, Razzak SA, Kanji A, et al. Whole-genome sequencing reveals genotypic resistance in phenotypically susceptible Mycobacterium tuberculosis clinical isolates. International Journal of Mycobacteriology. 2023;12(2):179-183. DOI: https://doi.org/10.4103/ijmy.ijmy_101_23</mixed-citation></ref><ref id="B13"><mixed-citation>Пушилина АД, Коменкова ТС, Зайцева ЕА. Современные представления о механизмах формирования резистентности микроорганизмов к антимикробным препаратам. Медико-фармацевтический журнал &amp;laquo;Пульс&amp;raquo;. 2019;21(10):125-130. DOI: http://dx.doi.org/10.26787/nydha-2686-6838-2019-21-10-125-130</mixed-citation></ref><ref id="B14"><mixed-citation>Гребнев ДЮ, Осипенко АВ, Рябов РВ, и др. Макроаутофагия и ее роль в патогенезе туберкулеза. Вестник уральской медицинской академической науки. 2021;18(2):95-109. DOI: https://doi.org/10.22138/2500-0918-2021-18-2-95-109</mixed-citation></ref><ref id="B15"><mixed-citation>Фелькер ИГ, Гордеева ЕИ, Ставицкая НВ, и др. Перспективы и препятствия для клинического применения ингибиторов эффлюксных помп Мycobacterium tuberculosis. &amp;nbsp;Биологические мембраны. 2021;38(5):317-339. DOI: https://doi.org/10.31857/S0233475521050054</mixed-citation></ref><ref id="B16"><mixed-citation>Носова ЕЮ, Хахалина АА, Исакова АИ, и др. Одновременное определение генетических детерминант широкой лекарственной устойчивости и генотипирование M. tuberculosis с помощью гибридизационного анализа на биочипах. Туберкулёз и социально значимые заболевания. 2016;2:24-32.</mixed-citation></ref><ref id="B17"><mixed-citation>Maruri F, Guo Y, Blackman A, et al. Resistance-Conferring Mutations on Whole-Genome Sequencing of Fluoroquinolone-resistant and -Susceptible Mycobacterium tuberculosis Isolates: A Proposed Threshold for Identifying Resistance. Clinical Infectious Diseases. 2021;72(11):1910-1918. DOI: https://doi.org/10.1093/cid/ciaa496</mixed-citation></ref><ref id="B18"><mixed-citation>Хахалина АА, Краснова ЕМ, Белиловский ИВ, и др. Структура популяции Mycobacterium tuberculosis с множественной лекарственной устойчивостью на территории Москвы. Туберкулёз и социально значимые заболевания. 2019;2:29-39.</mixed-citation></ref><ref id="B19"><mixed-citation>Faksri K, Kaewprasert O, Ong RTH, et al. Comparisons of whole-genome sequencing and phenotypic drug susceptibility testing for Mycobacterium tuberculosis causing MDR-TB and XDR-TB in Thailand. International Journal of Antimicrobial Agents. 2019;54(2):109-116. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2019.04.004</mixed-citation></ref><ref id="B20"><mixed-citation>Сутормин ДА, Галивонджян АХ, Полховский АВ, и др. Разнообразие и функции топоизомераз типа II. Acta Naturae. 2021;13(1):59-70. DOI: https://doi.org/10.32607/actanaturae.11058</mixed-citation></ref><ref id="B21"><mixed-citation>Byl JAW, Mueller R, Bax B, et al. A Series of Spiropyrimidinetriones that Enhances DNA Cleavage Mediated by Mycobacterium tuberculosis Gyrase. ACS Infectious Diseases. 2023;9(3):706-715. DOI: https://doi.org/10.1021/acsinfecdis.3c00012</mixed-citation></ref><ref id="B22"><mixed-citation>Егоров АM, Уляшова ММ, Рубцова МЮ. Бактериальные ферменты и резистентность к антибиотикам. Acta Naturae. 2018;10(4):33-48.</mixed-citation></ref><ref id="B23"><mixed-citation>Avalos E, Catanzaro D, Catanzaro A, et al. Frequency and Geographic Distribution of gyrA and gyrB Mutations Associated with Fluoroquinolone Resistance in Clinical Mycobacterium Tuberculosis Isolates: A Systematic Review. PLoS ONE. 2015;10(3):e0120470. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0120470</mixed-citation></ref><ref id="B24"><mixed-citation>Bi J, Guo Q, Fu X,&amp;nbsp;et al. Characterizing the gene mutations associated with resistance to gatifloxacin in Mycobacterium tuberculosis through whole-genome sequencing. International Journal of Infectious Diseases. 2021;112:189-194. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ijid.2021.09.028</mixed-citation></ref><ref id="B25"><mixed-citation>Tang J, Brynildsen MP. Genome-wide mapping of fluoroquinolone-stabilized DNA gyrase cleavage sites displays drug specific effects that correlate with bacterial persistence. Nucleic Acids Research. 2013;51(3):1208-1228. DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkac1223</mixed-citation></ref><ref id="B26"><mixed-citation>Singh PK, Singh U, Jain A. Emergence of Specific gyrA Mutations Associated High-Level Fluoroquinolone-Resistant Mycobacterium tuberculosis among Multidrug-Resistant Tuberculosis Cases in North India. Microbial Drug Resistance. 2021;27(5):647-651. DOI: https://doi.org/10.1089/mdr.2020.0240</mixed-citation></ref><ref id="B27"><mixed-citation>Brankin AE, Flower PW. Inclusion of minor alleles improves catalogue-based prediction of fluoroquinolone resistance in Mycobacterium tuberculosis. JAC-Antimicrobial Resistance. 2023;5(2):dlad039. DOI: https://doi.org/10.1093/jacamr/dlad039</mixed-citation></ref><ref id="B28"><mixed-citation>Wang Z, Sun R, Mu C, et al. Characterization of Fluoroquinolone-Resistant and Multidrug-Resistant Mycobacterium tuberculosis Isolates Using Whole-Genome Sequencing in Tianjin, China. Infection and Drug Resistance. 2022;15:1793-1803. DOI: https://doi.org/10.2147/IDR.S361635</mixed-citation></ref><ref id="B29"><mixed-citation>Singh A, Zhao X, Drlica K. Fluoroquinolone heteroresistance, antimicrobial tolerance, and lethality enhancement. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2022;12:938032. DOI: https://doi.org/10.3389/fcimb.2022.938032</mixed-citation></ref><ref id="B30"><mixed-citation>Malik S, Willby M, Sikes D, et al. New Insights into Fluoroquinolone Resistance in Mycobacterium tuberculosis: Functional Genetic Analysis of gyrA and gyrB Mutations. PLoS ONE. 2012;7(6):e39754. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0039754</mixed-citation></ref><ref id="B31"><mixed-citation>Matrat S, Aubry A, Mayer C, et al. Mutagenesis in the &amp;alpha;3&amp;alpha;4 GyrA helix and in the toprim domain of GyrB refines the contribution of Mycobacterium tuberculosis DNA gyrase to intrinsic resistance to quinolones. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 2008;52(8):2909-2914. DOI: https://doi.org/10.1128/AAC.01380-07</mixed-citation></ref><ref id="B32"><mixed-citation>Mujuni D, Kasemire DL, Ibanda I, et al. Molecular characterisation of second-line drug resistance among drug resistant tuberculosis patients tested in Uganda: a two and a half-year&amp;rsquo;s review. BMC Infectious Diseases. 2022;22:363. DOI: https://doi.org/10.1186/s12879-022-07339-w</mixed-citation></ref><ref id="B33"><mixed-citation>Sayadi M, Zare H, Jamedar SA, et al. Genotypic and phenotypic characterization of Mycobacterium tuberculosis resistance against fluoroquinolones in the northeast of Iran. BMC Infectious Diseases. 2020;20:390. DOI: https://doi.org/10.1186/s12879-020-05112-5</mixed-citation></ref><ref id="B34"><mixed-citation>Шур КВ, Беккер ОБ, Зайчикова МВ, и др. Генетические аспекты лекарственной устойчивости и вирулентности Mycobacterium tuberculosis. Генетика. 2018;54(12):1363-1375. DOI: https://doi.org/10.1134/S0016675818120147</mixed-citation></ref><ref id="B35"><mixed-citation>Chien JY, Chiu WY, Chien ST, et al. Mutations in gyrA and gyrB among Fluoroquinolone- and Multidrug-Resistant Mycobacterium tuberculosis Isolates. &amp;nbsp;Antimicrobial Agents and Chemotherapy.&amp;nbsp;2016;60(4):2090-2096. DOI: https://doi.org/10.1128/AAC.01049-15</mixed-citation></ref><ref id="B36"><mixed-citation>Lau RWT, Ho PL, Kao RYT, et al. Molecular characterization of fluoroquinolone resistance in Mycobacterium tuberculosis: functional analysis of gyrA mutation at position 74. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 2011;55(2):608-614. DOI: https://doi.org/10.1128/AAC.00920-10</mixed-citation></ref><ref id="B37"><mixed-citation>Zhang X, Chen X, Wang B, et al. Molecular characteristic of both levofloxacin and moxifloxacin resistance in Mycobacterium tuberculosis from individuals diagnosed with preextensive dug-resistant tuberculosis. Microbial Drug Resistance. 2022;28(3):280-287. DOI: https://doi.org/10.1089/mdr.2021.0212</mixed-citation></ref><ref id="B38"><mixed-citation>Yadav R, Saini A, Agarwal P, et al. A Rare D94F Change in gyrA Gene of Multidrug-Resistant Mycobacterium tuberculosis Possibly Contributing to an Unfavorable Treatment Outcome. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 2019;63(11):e01312-19. DOI: https://doi.org/10.1128/AAC.01312-19</mixed-citation></ref><ref id="B39"><mixed-citation>Mahmood N, Abbas SN, Faraz N, et al. Mutation analysis of gyrB at amino acid: G481A&amp;amp; D505A in multi drug resistance (MDR) tuberculosis patients. Journal of Infection and Public Health. 2019;12(4):496-501.&amp;nbsp;DOI: https://doi.org/10.1016/j.jiph.2019.01.056</mixed-citation></ref><ref id="B40"><mixed-citation>Willby M, Chopra P, Lemmer D, et al. Molecular evaluation of fluoroquinolone resistance in serial Mycobacterium tuberculosis isolates from individuals diagnosed with multidrug-resistant tuberculosis. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 2020;65(51):860-865. DOI: https://doi.org/10.1128/AAC.01663-20</mixed-citation></ref><ref id="B41"><mixed-citation>Qiao M, Ren W, Guo H, et al. Comparative in vitro susceptibility of a novel fluoroquinolone antibiotic candidate WFQ-228, levofloxacin, and moxifloxacin against Mycobacterium tuberculosis. International Journal of Infectious Diseases. 2021;106:295-299. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ijid.2021.04.036</mixed-citation></ref><ref id="B42"><mixed-citation>Kamsri B, Pakamwong B, Thongdee P, et al. Bioisosteric Design Identifies Inhibitors of Mycobacterium tuberculosis DNA Gyrase ATPase Activity. Journal of Chemical Information and Modeling. 2023;63(9):2707-2718. DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c01376</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>