16+
DOI: 10.18413/2658-6533-2023-9-4-0-3

Связь однонуклеотидного полиморфизма rs4880 гена SOD2 с развитием микрососудистых осложнений сахарного диабета 2-го типа

Aннотация

Актуальность: Ген супероксиддисмутазы 2 (SOD2) кодирует митохондриальный фермент, главной функцией которого является превращение супероксид-аниона в перекись водорода. Генетически детерминированное снижение активности фермента SOD2 в случае однонуклеотидной замены rs4880 (А>G) может способствовать развитию нарушения редокс-баланса митохондрий бета-клеток поджелудочной железы и других тканей, имеющих патогенетическое значение для возникновения сахарного диабета 2 типа (СД2) и его микрососудистых осложнений. Цель исследования:Провести анализ ассоциаций миссенс-варианта rs4880 SOD2, приводящего к замене валина на аланин в белковом продукте гена,с риском развития СД2 и его микрососудистых осложнений – диабетической ретинопатии (ДР) и нефропатии (ДНФ). Материалы и методы:В исследованиевключено 3206 человек, жителей Центральной России, у 1579 из которых диагностирован СД2. При этом у 991 пациента с СД2 установлено наличие ДР, у 544 больных СД2 выявлена ДНФ. Генотипирование выполнено методом полимеразно-цепной реакции в реальном режиме времени на термоциклере CFX1000 Bio-Rad с использованием TaqMan зондов.Статистический анализ ассоциацийвыполнен с помощью онлайн программы SNPStats. Результаты:Установлена ассоциация минорного аллеля G (OR=1,26, 95% CI=1,02-1,56, P=0,033), а также генотипов А/G и G/G rs4880 (OR=1,51, 95% CI=1,09-2,11, P=0,015) c риском развития ДР у больных СД2 женщин. Статистически значимых ассоциаций rs4880 с СД2 и с развитием ДНФ ни у мужчин, ни у женщин выявлено не было: Р>0.05. По данным транскриптомного анализа поджелудочной железы, нервной и сосудистой тканей (GTEx Portal), вариантный аллель Gсвязан со снижением экспрессии белка MRPL18, необходимого для транспортировки важнейшего компонента рибосом 5S рРНК из цитозоля в митохондрии и обеспечения рибосомального синтеза белка. Заключение:Носительство минорного аллеля rs4880-G является генетическим маркером повышенного риска развития диабетической ретинопатии у женщин с СД2


Введение. Сахарный диабет 2 типа (СД2) представляет собой серьезное хроническое заболевание, которое развивается на фоне дисфункции инсулин-продуцирующих бета-клеток поджелудочной железы и инсулинорезистентности периферических тканей [1]. За последние двадцать лет общее число больных сахарным диабетом в мире выросло более чем в три раза – с 151 млн человек в 2000 г. до 537 млн человек в 2021 г., при этом абсолютное большинство пациентов имеют СД2 [2]. Если эта тенденция пандемического роста заболеваемости сохранится, то по прогнозам экспертов к 2030 г. число пациентов превысит 643 млн человек, что составит 11,3% населения Земного шара [3].

СД2 характеризуется нарушениями всех видов обмена веществ и входит в группу свободно-радикальной патологии, поскольку именно сдвиг в редокс-гомеостазе является движущей силой естественного течения заболевания и формирования его осложнений [4, 5, 6]. Хроническая гипергликемия, избыточное образование свободных радикалов НАДФН-оксидазами [7] и дыхательной цепью митохондрий [8], дефицит эндогенных антиоксидантов [9] являются главными факторами, приводящими к структурным и функциональным изменениям в сетчатке, нервах и сосудах различных тканей и органов, что, в частности, провоцирует развитие микрососудистых (диабетической ретинопатии (ДР) и диабетической нефропатии (ДНФ)) и макрососудистых (ишемическая болезнь сердца, острые нарушения мозгового кровообращения) осложнений СД2 [10, 11].

Исследования последних лет показали, что образование активных форм кислорода в митохондриях служит основой нескольких связанных с гипергликемией патогенетических механизмов развития болезни, таких как ингибирование глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы, активация аутоокисления и полиолового пути метаболизма глюкозы, активация протеинкиназы С, 12/15-липоксигеназного пути, а также образования конечных продуктов гликирования [12, 13, 14]. Перечисленные процессы способны усугублять окислительный стресс. Так, ферменты полиолового пути расходуют НАДФН·Н+, тормозя его использование для восстановления окисленного димера клеточного антиоксиданта глутатиона в исходную активную мономерную форму [14]. В то же время взаимодействие конечных продуктов гликирования с их рецепторами приводит к новому витку генерации активных форм кислорода [15], что грозит инициацией сигналинга белка р53 и, как следствие, высвобождением цитохрома с из внутренней мембраны митохондрий с запуском апоптоза клетки [16]. В этой связи первостепенное значение для защиты клетки в условиях избыточного окисления субстатов имеют митохондриальные изоформы антиоксидантных ферментов, к которым относится супероксиддисмутаза 2 (СОД2), катализирующая превращение супероксид-аниона в перекись водорода согласно уравнению: 2H+ + 2О2.- = H2O2 + O2 [17]. Фермент кодируется расположенным на длинном плече шестой хромосомы (6q25.3) геном SOD2. Согласно литературным данным, миссенс-вариант SOD2 rs4880 (A>G) характеризуется заменой валина на аланин, что снижает ферментативную активность белка [17]. Ранее были описаны ассоциации варианта rs4880 с диабетической нефропатией у европейцев [18], японцев [19] и китайцев [20], однако валидационных исследований выявленной ассоциации в русской популяции выполнено не было, что обосновывает актуальность настоящей работы.

Цель исследования. Провести анализ ассоциаций миссенс-варианта rs4880 SOD2 с риском развития СД2 и его микрососудистых осложнений – диабетической ретинопатии и нефропатии у жителей Центральной России.

Материалы и методы исследования. Дизайн исследования одобрен Региональным этическим комитетом при Курском государственном медицинском университете (выписка из протокола №10 от 12.12.2016 г.). Все пациенты дали письменное информированное согласие на участие в исследовании. Группа больных СД2 (1579 человек – 591 мужчина и 988 женщин, средний возраст 61,3±10,4 года) была набрана из числа пациентов эндокринологического отделения Курской городской клинической больницы скорой медицинской помощи в период с 2016 по 2019 годы. Диагноз СД2 устанавливали врачи-эндокринологи на основании критериев ВОЗ [21]. При этом у 991 пациента с СД2 установлено наличие ДР, у 544 больных СД2 выявлена ДНФ. Группу контроля (1627 человек – 601 мужчина и 1026 женщин, средний возраст 60,8±6,4 года) составили относительно здоровые доноры Курского областного клинического центра крови. Критерии включения и исключения из исследования были подробно изложены нами ранее [22]. У всех участников исследования был организован забор 5 мл крови натощак в вакуумные пробирки с ЭДТА для последующей фенольно-хлороформной экстракции геномной ДНК. Генотипирование выполнено методом полимеразно-цепной реакции в реальном режиме времени на термоциклере С1000 Touch Thermal Cycler CFX96 (Bio-Rad) с использованием TaqMan зондов. Праймеры и зонды были синтезированы компанией Синтол (Москва). Статистический анализ полученных данных проведен методом логистической регрессии с поправками на пол, возраст и индекс массы тела с помощью онлайн программы SNPStats [23]. Ассоциация считалась значимой при Р<0,05. 

Результаты и их обсуждение. Распределение частот генотипов в исследуемой популяции соответствовало равновесию Харди-Вайнберга (P>0,05). В таблице 1 приведены результаты расчета ассоциаций изучаемого однонуклеотидного варианта с предрасположенностью к СД2. Как видно из таблицы 1, носительство полиморфизма rs4880 не было связано с развитием СД2 ни в общей группе, ни отдельно у мужчин и женщин.

В таблице 2 показаны результаты анализа ассоциаций rs4880 с микрососудистыми осложнениями СД2. Установлена ассоциация минорного аллеля G (OR=1,26, 95% CI=1,02-1,56, P=0,033), а также генотипов  А/G и G/G (OR=1,51, 95% CI=1,09-2,11, P=0,015) c риском развития ДР у больных СД2 женщин, тогда как статистически значимых ассоциаций с развитием ДНФ выявлено не было: Р>0,05.

Анализ взаимодействий кодируемого геном SOD2 фермента с другими белками (Рис. 1), выполненный с использованием инструмента STRING, показал, что интерактом супероксиддисмутазы 2 включает в себя супероксиддисмутазу 1 (SOD1), каталазу (CAT), глутатионпероксидазу 7 (GPX7), 1-альфа коактиватор рецептора гамма, активируемого пролифераторами пероксисом (PPARGC1A), дегликазу DJ-1 (PARK7), транскрипционный фактор (FOXO3), гистоновую деацетилазу (KAT2A) и WD-повтор содержащий белок 5 (WDR5). Анализ генных онтологий выявил основные функции описанной белковой сети: клеточный ответ на окислительный стресс (FDR=1,38×10-7), положительная регуляция биосинтеза активных форм кислорода (FDR=0,00015) и отрицательная регуляция индуцированного окислительным стрессом сигнального пути апоптоза (FDR=0,0102).

Как фермент, обеспечивающий устойчивость к окислительному стрессу, супероксиддисмутаза 2 является частью белкового интерактома (также включающего шапероны, белки энергетического метаболизма, репарации ДНК и аутофагии), регулирующего процессы старения и продолжительность жизни человека и других биологических видов (Рис. 2, KEGG Pathways).

Изучаемый однонуклеотидный вариант rs4880 (A>G) приводит к замене валина на аланин в 16-м положении полипептидной цепи белкового продукта. В исследовании Bastaki [24] показано, что активность фермента у носителей генотипов A/A и A/G была на 33% выше по сравнению с носителями генотипа G/G, однако в более ранней работе Sutton [25] были получены противоположные результаты. В этой связи нами был проведен биоинформатический анализ эффектов альтернативного аллеля rs4880-G на экспрессию SOD2. По данным транскриптомного анализа (GTEx Portal) аллель rs4880-G ассоциирован со снижением экспрессии гена SOD2 в сердечной мышце (NES=-0,11, P=0,0000053). Этот же аллель связан со снижением экспрессии гена MRPL18 в поджелудочной железе (NES=-0.19, P=0,000026), сердце (NES=-0,21, P=6,1×10-10), аорте (NES=-0,17, P=2,9×10-8), скелетной мышечной ткани (NES=-0,15, P=6,8×10-12), подкожной жировой клетчатке (NES=-0,24, P=6,2×10-18), большеберцовой артерии (NES=-0,19, P=1,5×10-16) и большеберцовом нерве (NES=-0,25, P=1,8×10-21). Следует отметить, что митохондриальный рибосомальный белок L18 (MRPL18) необходим для транспортировки из цитозоля в митохондрии важнейшего компонента рибосом 5S рРНК, кодируемого не митохондриальной, а геномной ДНК (Uniprot, https://www.uniprot.org/). Снижение экспрессии MRPL18 способно оказать негативное влияние на рибосомальный синтез белков в митохондриях тканей, патогенетически связанных с развитием СД2 и его осложнений. 

По данным ресурса mqtl.db (http://www.mqtldb.org/), депонирующего результаты анализа метилирования ДНК у человека в различные возрастные периоды жизни, влияние аллеля rs4880-G на метилирование CpG-островков в гене SOD2 у взрослых людей носит неоднозначный характер: носительство минорного аллеля G ассоциировано с гипометилированием одних CpG-островков и с гиперметилированием других (Табл. 3).

Нами впервые установлена ассоциация rs4880 с диабетической ретинопатией у женщин с СД2. В литературе описаны ассоциации изучаемого полиморфного варианта с диабетической нефропатией при сахарном диабете 1 типа в популяции финнов и шведов [18], а также с диабетической нефропатией у больных СД2 японцев [19] и китайцев [20]. Недиабетические фенотипы, ассоциированные с rs4880, включают кардиомиопатию у пациентов с гемахроматозом [26], идипатическую кардиомиопатию [27], плевральную мезотелиому [28], рак простаты [29] и болезнь Альцгеймера [30].

Семейство супероксиддисмутаз у человека включает в себя три изоформы – цитозольную супероксиддисмутазу 1, митохондриальную супероксиддисмутазу 2 и внеклеточную супероксиддисмутазу 3 [17]. Установленный нами факт ассоциации с ДР loss-of-function варианта rs4880 в гене, кодирующем супероксиддисмутазу 2, имеет непосредственное патогенетическое значение для развития этого осложнения СД2 ввиду того, что снижение каталитической активности фермента у носителей минорного аллеля rs4880-G способствует формированию окислительного стресса в митохондриях и их дисфункции. Показано, что хроническая гипергликемия индуцирует генерацию АФК в митохондриях, что изменяет экспрессию генов за счет ковалентной модификации транскрипционных факторов [31, 32] и вызывает увеличение содержания в сетчатке проапоптотических митохондриальных белков, таких как цитохром с и апоптоз-индуцирующий фактор (AIF) [33]. Действительно, исследования in vitro установили усиление фрагментации митохондрий и активацию апоптоза клеток в условиях гипергликемии [34]. Кроме того, в экспериментальной работе на мышах с СД2 выявлено значительное повышение генерации АФК в сетчатке, причем подавление синтеза АФК ингибировало опосредованный каспазой 3 апоптоз нейронов и замедляло потерю зрения [35]. Считается, что именно дисфункция митохондрий является причиной нейродегенерации сетчатки, предшествующей появлению сосудистых нарушений при ДР [36].

Заключение. Носительство минорного аллеля rs4880-G является генетическим маркером повышенного риска развития диабетической ретинопатии у женщин с СД2. Повышенный риск развития ДР у носительниц минорного аллеля rs4880-G может быть связан со снижением активности митохондриальной супероксиддисмутазы 2 как в результате аминокислотной замены валина на аланин, так и в результате отрицательного влияния аллеля G на экспрессию генов SOD2 и MRPL18 в сосудистой и нервной тканях, что способствует становлению митохондриальной дисфункции – важнейшего звена патогенеза ретинальной нейродегенерации и поражения сосудов сетчатки при сахарном диабете 2 типа.

Информация о финансировании

Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда (проект № 20-15-00227).

Список литературы

  1. Дедов ИИ, Шестакова МВ, Викулова ОК, и др. Эпидемиологические характеристики сахарного диабета в Российской Федерации: клинико-статистический анализ по данным регистра сахарного диабета на 01.01.2021. Сахарный диабет. 2021;24(3):204-221. DOI: https://doi.org/10.14341/DM12759
  2. Sun H, Saeedi P, Karuranga S, et al. IDF Diabetes Atlas: Global, regional and country-level diabetes prevalence estimates for 2021 and projections for 2045. Diabetes Research and Clinical Practice. 2022;183:109119. DOI: https://doi.org/10.1016/j.diabres.2021.109119
  3. Ali MK, Pearson-Stuttard J, Selvin E, et al. Interpreting global trends in type 2 diabetes complications and mortality. Diabetologia. 2022;65(1):3-13. DOI: https://doi.org/10.1007/s00125-021-05585-2
  4. Singh A, Kukreti R, Saso L, et al. Mechanistic Insight into Oxidative Stress-Triggered Signaling Pathways and Type 2 Diabetes. Molecules. 2022;27(3):950. DOI: https://doi.org/10.3390/molecules27030950
  5. Azarova I, Polonikov A, Klyosova E. Molecular Genetics of Abnormal Redox Homeostasis in Type 2 Diabetes Mellitus. International Journal of Molecular Sciences. 2023;24(5):4738. DOI: https://doi.org/10.3390/ijms24054738
  6. Azarova I, Klyosova E, Polonikov A. The Link between Type 2 Diabetes Mellitus and the Polymorphisms of Glutathione-Metabolizing Genes Suggests a New Hypothesis Explaining Disease Initiation and Progression. Life. 2021;11(9):886. DOI: https://doi.org/10.3390/life11090886
  7. Vilas-Boas EA, Almeida DC, Roma LP. Lipotoxicity and β-cell failure in type 2 diabetes: Oxidative stress linked to NADPH oxidase and ER stress. Cells. 2021;10(12):3328. DOI: https://doi.org/10.3390/cells10123328
  8. Dai W, Jiang L. Dysregulated mitochondrial dynamics and metabolism in obesity, diabetes, and cancer. Frontiers in Endocrinology. 2019;10:570. DOI: https://doi.org/10.3389/fendo.2019.00570
  9. Darenskaya MA, Kolesnikova LI, Kolesnikov SI. Oxidative stress: pathogenetic role in diabetes mellitus and its complications and therapeutic approaches to correction. Bulletin of Experimental Biology and Medicine. 2021;171(2):179-189. DOI: https://doi.org/10.1007/s10517-021-05191-7
  10. Iacobini C, Vitale M, Pesce C, et al. Diabetic complications and oxidative stress: A 20-year voyage back in time and back to the future. Antioxidants. 2021;10(5):727. DOI: https://doi.org/10.3390/antiox10050727
  11. Papachristoforou E, Lambadiari V, Maratou E, et al. Association of glycemic indices (hyperglycemia, glucose variability, and hypoglycemia) with oxidative stress and diabetic complications. Journal of Diabetes Research. 2020;2020:7489795. DOI: https://doi.org/10.1155/2020/7489795
  12. Du X, Matsumura T, Edelstein D, et al. Inhibition of GAPDH activity by poly(ADP-ribose) polymerase activates three major pathways of hyperglycemic damage in endothelial cells. Journal of Clinical Investigation. 2003;112:1049-1057. DOI: https://doi.org/10.1172/JCI18127
  13. Garg SS, Gupta J. Polyol pathway and redox balance in diabetes. Pharmacological Research. 2022;182:106326. DOI: https://doi.org/10.1016/j.phrs.2022.106326
  14. Zhang ZY, Miao LF, Qian LL, et al. Molecular mechanisms of glucose fluctuations on diabetic complications. Frontiers in Endocrinology. 2019;10:640. DOI: https://doi.org/10.3389/fendo.2019.00640
  15. Ramasamy R, Shekhtman A, Schmidt AM. The RAGE/DIAPH1 signaling axis & implications for the pathogenesis of diabetic complications. International Journal of Molecular Sciences. 2022;23(9):4579. DOI: https://doi.org/10.3390/ijms23094579
  16. Demirtas L, Guclu A, Erdur FM, et al. Apoptosis, autophagy & endoplasmic reticulum stress in diabetes mellitus. Indian Journal of Medical Research. 2016;144(4):515-524. DOI: https://doi.org/10.4103/0971-5916.200887
  17. Pourvali K, Abbasi M, Mottaghi A. Role of superoxide dismutase 2 gene Ala16Val polymorphism and total antioxidant capacity in diabetes and its complications. Avicenna Journal of Medical Biotechnology. 2016;8(2):48-56.
  18. Möllsten A, Marklund SL, Wessman M, et al. A functional polymorphism in the manganese superoxide dismutase gene and diabetic nephropathy. Diabetes. 2007;56(1):265-269. DOI: https://doi.org/10.2337/db06-0698
  19. Nomiyama T, Tanaka Y, Piao L, et al. The polymorphism of manganese superoxide dismutase is associated with diabetic nephropathy in Japanese type 2 diabetic patients. Journal of Human Genetics. 2003;48(3):138-141. DOI: https://doi.org/10.1007/s100380300021
  20. Liu L, Zheng T, Wang N, et al. The manganese superoxide dismutase Val16Ala polymorphism is associated with decreased risk of diabetic nephropathy in Chinese patients with type 2 diabetes. Molecular and Cellular Biochemistry. 2009;322(1-2):87-91. DOI: https://doi.org/10.1007/s11010-008-9943-x
  21. World Health Organization. Global report on diabetes: executive summary (No. WHO/NMH/NVI/16.3). World Health Organization; 2016.
  22. Azarova I, Klyosova E, Polonikov A. Association between RAC1 gene variation, redox homeostasis and type 2 diabetes mellitus. European Journal of Clinical Investigation. 2022;52(8):13792. DOI: https://doi.org/10.1111/eci.13792
  23. Solé X, Guinó E, Valls J, et al. SNPStats: a web tool for the analysis of association studies. Bioinformatics. 2006;22(15):1928-1929. DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btl268
  24. Bastaki M, Huen K, Manzanillo P, et al. Genotype-activity relationship for Mn-superoxide dismutase, glutathione peroxidase 1 and catalase in humans. Pharmacogenetics and Genomics. 2006;16(4):279-286. DOI: https://doi.org/10.1097/01.fpc.0000199498.08725.9c
  25. Sutton A, Imbert A, Igoudjil A, et al. The manganese superoxide dismutase Ala16Val dimorphism modulates both mitochondrial import and mRNA stability. Pharmacogenetics and Genomics. 2005;15(5):311-319. DOI: https://doi.org/10.1097/01213011-200505000-00006
  26. Valenti L, Conte D, Piperno A, et al. The mitochondrial superoxide dismutase A16V polymorphism in the cardiomyopathy associated with hereditary haemochromatosis. Journal of Medical Genetics. 2004;41(12):946-950. DOI: https://doi.org/10.1136/jmg.2004.019588
  27. Hiroi S, Harada H, Nishi H, et al. Polymorphisms in the SOD2 and HLA-DRB1 genes are associated with nonfamilial idiopathic dilated cardiomyopathy in Japanese. Biochemical and Biophysical Research Communications. 1999;261(2):332-339. DOI: https://doi.org/10.1006/bbrc.1999.1036
  28. Landi S, Gemignani F, Neri M, et al. Polymorphisms of glutathione-S-transferase M1 and manganese superoxide dismutase are associated with the risk of malignant pleural mesothelioma. International Journal of Cancer. 2007;120(12):2739-2743. DOI: https://doi.org/10.1002/ijc.22590
  29. Choi JY, Neuhouser ML, Barnett MJ, et al. Iron intake, oxidative stress-related genes (MnSOD and MPO) and prostate cancer risk in CARET cohort. Carcinogenesis. 2008;29(5):964-970. DOI: https://doi.org/10.1093/carcin/bgn056
  30. Wiener HW, Perry RT, Chen Z, et al. A polymorphism in SOD2 is associated with development of Alzheimer's disease. Genes, Brain and Behavior. 2007;6(8):770-775. DOI: https://doi.org/10.1111/j.1601-183x.2007.00308.x
  31. Yao D, Taguchi T, Matsumura T, et al. High glucose increases angiopoietin-2 transcription in microvascular endothelial cells through methylglyoxal modification of mSin3A. J Biol Chem. 2007;282(42):31038-31045. DOI: https://doi.org/10.1074/jbc.M704703200
  32. Hammes HP, Feng Y, Pfister F, et al. Diabetic retinopathy: targeting vasoregression. Diabetes. 2011;60(1):9-16. DOI: https://doi.org/10.2337/db10-0454
  33. Abu-El-Asrar AM, Dralands L, Missotten L, et al. Expression of apoptosis markers in the retinas of human subjects with diabetes. Investigative Ophthalmology and Visual Science. 2004;45(8):2760-2766. DOI: https://doi.org/10.1167/iovs.03-1392
  34. Tien T, Zhang J, Muto T, et al. High glucose induces mitochondrial dysfunction in retinal muller cells: Implications for diabetic retinopathy. Investigative Ophthalmology and Visual Science. 2017;58:2915-2921. DOI: https://doi.org/10.1167/iovs.16-21355
  35. Sasaki M, Ozawa Y, Kurihara T, et al. Neurodegenerative influence of oxidative stress in the retina of a murine model of diabetes. Diabetologia. 2010;53:971-979. DOI: https://doi.org/10.1007/s00125-009-1655-6
  36. Sohn EH, van Dijk HW, Jiao C, et al. Retinal neurodegeneration may precede microvascular changes characteristic of diabetic retinopathy in diabetes mellitus. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2016;113(9):E2655-E2664. DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.1522014113