Изучение роли межлокусных взаимодействий генов фолатного цикла и матриксных металлопротеиназ в формировании задержки роста плода
Актуальность: Задержка развития плода (ЗРП) является одним из наиболее частых осложнений беременности, которое может неблагоприятно сказаться на краткосрочном и долгосрочном здоровье новорожденных. Поиск материнских полиморфизмов генов-кандидатов, вовлеченных в формирование ЗРП является актуальным. Цель исследования:Изучить роль межлокусных взаимодействий генов фолатного цикла и матриксных металлопротеиназ в формировании задержки роста плода. Материалы и методы:Обследовано 477 беременных женщин (234 женщин – у которых беременность осложнилась задержкой внутриутробного развития плода и 243 женщины, у которых наблюдалось физиологическое течение беременности (группа контроля)). Проводилось изучение SNP×SNP взаимодействий 10 полиморфных локусов генов матриксных металлопротеиназ и генов, влияющих на фолатный цикл, ассоциированных с развитием ЗРП, методом снижения размерности (MDR метод в модификации MB-MDR). Валидация результатов проводилось с помощью пермутационного теста (выполнялось 1000 пермутаций). Полиморфизмы, связанные с ЗРП, были проанализированы in silico на предмет их функционального значения. Для определения биологических путей использовались программы: Gene Ontology и Genomania. Результаты:Установлено 7 наиболее значимых моделей SNP×SNP взаимодействий генов матриксных металлопротеиназ и фолатного цикла, ассоциированных с развитием ЗРП, в состав которых входят восемь из 10 рассматриваемых SNPs: rs1805087 MTR, rs1801394 MTRR, rs1979277 SHMT1, rs1799750 MMP-1, rs243865 MMP-2, rs3025058 MMP-3, rs11568819 MMP-7, rs17577 MMP-9 (рperm≤0,05). В наибольшее число моделей входят полиморфные локусы rs1979277 (7 моделей), rs243865 (4 модели), rs3025058 (3 модели). Двухлокусная комбинация генотипов ТТ rs243865 MMP2 х ТТ rs1979277 SHMT1 (beta = - 0,68, p=0,001) имеет наиболее значимую ассоциацию с ЗРП. Данные полиморфизмы проявляют выраженные функциональные эффекты по отношению к 38 генам, которые вовлечены в биологические пути метаболизма коллагена (преимущественно в его катаболический распад) и модуляции активности матриксных металлопротеиназ (преимущественно в процессы повышения активности матриксных металлопротеиназ, обусловливающих распад внеклеточного матрикса). Заключение:Межлокусные взаимодействия генов фолатного цикла и матриксных металлопротеиназ определяют подверженность к задержке роста плода.
Ефремова ОА. Изучение роли межлокусных взаимодействий генов фоланого цикла и матриксных металлопротеиназ в формировании задержки роста плода. Научные результаты биомедицинских исследований. 2022;8(1):36-55.[Efremova OA. Studying the role of interlocus interactions of folate cycle genes and matrix metalloproteinases in the formation of fetal growth retardation. Research Results in Biomedicine. 2022;8(1):36-55. Russian]. DOI: 10.18413/2658-6533-2022-8-1-0-3
Пока никто не оставил комментариев к этой публикации.
Вы можете быть первым.