Ассоциации полиморфных вариантов генов-кандидатов с развитием H. pylori-негативной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки у жителей Центрального Черноземья России
Актуальность: Язвенная болезнь (ЯБ) – это хроническое рецидивирующее заболевание, протекающее с чередованием периодов обострения и ремиссии, ведущим проявлением которого служит образование дефекта (язвы) в стенке желудка и двенадцатиперстной кишки. Наследственная предрасположенность является одним из этиопатогенетических факторов развития ЯБ, следовательно, требуется изучение генетических детерминант заболевания. Цель исследования: Изучить роль специально отобранных для исследования 9 полиморфных вариантов генов-кандидатов Н. pylori-негативной ЯБ ДПК (GWAS-значимые для ЯБ: rs2294008 PSCA, rs505922 ABO; гены молекул клеточной адгезии, патогенетически значимые для развития Н. pylori-негативной ЯБ ДПК: rs6136 SELP; rs8176720, rs2519093, rs507666 ABO; rs651007, rs579459, rs649129 ABO/RF00019) в развитии Н. pylori-негативной ЯБ ДПК у жителей Центрального Черноземья России. Материалы и методы: Объем выборки: 78 больных Н. pylori-негативной ЯБ ДПК, 347 лиц контрольной группы. Регуляторный потенциал выбранных для исследования локусов оценивался с помощью интернет-реcурсов HaploReg v4.1, PolyPhen-2 и GTEx Portal. Анализ ассоциаций проводился методом логистической регрессии в рамках аллельной, аддитивной, доминантной и рецессивной генетических моделей. Результаты: Аллель С гена SELP (rs6136) (аллельная модель: OR=1,88; 95%CI 1,13-3,13; pperm=0,024; аддитивная модель: OR=1,77; 95%CI 1,06-2,96; pperm=0,023; доминантная модель: OR=1,93; 95%CI 1,06-3,53; pperm=0,043) и аллель С гена PSCA (rs2294008) (рецессивная модель: OR=2,34; 95%CI 1,34-4,08; pperm=0,003) ассоциированы с повышенным риском развития Н. pylori-негативной ЯБ ДПК. Полиморфный вариант rs6136 SELP и 1 сильно сцепленный (r2≥0,8) с ним SNP влияют на экспрессию генаF5 и альтернативный сплайсинг гена BLZF1. Полиморфизм rs2294008PSCA и 48 сильно сцепленных (r2≥0,8) с ним локусов оказывают действие на экспрессию 11 генов (ARC, CTD-2292P10.4, JRK, LY6D, LY6K, LYNX1, LYPD2, PSCA, RP11-706C16.7, SLURP1, THEM6) и альтернативный сплайсинг 4 генов (JRK, LY6D, LYNX1, THEM6). Указанные гены играют роль в ключевых этиопатогенетических процессах при язвенной болезни: рост и деление клеток, посттрансляционная модификация гликозилфосфатидилинозитол-заякоренных белков, клеточная адгезия, реакции иммунной системы, активность никотиновых ацетилхолиновых рецепторов, гемостаз. Заключение: Аллель С гена SELP (rs6136) и аллель С гена PSCA (rs2294008) ассоциированы с повышенным риском развития Н. pylori-негативной ЯБ ДПК.
Рашина ОВ. Ассоциации полиморфных вариантов генов-кандидатов с развитием H. pylori-негативной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки у жителей Центрального Черноземья России. Научные результаты биомедицинских исследований. 2023;9(3):333-346. [Rashina OV. Associations of polymorphic variants of candidate genes with the development of H. pylori-negative duodenal ulcer in residents of the Central Chernozem region of Russia. Research Results in Biomedicine. 2023;9(3):333-346. Russian]. DOI: 10.18413/2658-6533-2023-9-3-0-4
Пока никто не оставил комментариев к этой публикации.
Вы можете быть первым.
DOI: https://doi.org/10.18413/2658-6533-2023-9-1-0-1